Unter Ubuntu wird die Tomcat (wie unter Linux üblich) verteilt über mehrere Verzeichnisse installiert. Leider kommt damit das Eclipse-Plugin nicht so klar. Es bringt beim konfigurieren immer folgende Fehlermeldung.

The Tomcat installation directory is not valid.
It is missing expected file or folder conf.

Um diesen Fehler zu beheben einfach folgende Befehle ausführen:

cd /usr/share/tomcat6
sudo ln -s /var/lib/tomcat6/conf conf
sudo touch /usr/share/tomcat6/conf/catalina.policy
sudo chown o+r /usr/share/tomcat6/conf/tomcat-users.xml